Solution 1 :
gdisk a une option pour cela. Ouvrez les options étendues, choisissez 'zap' :
gdisk /dev/sda
> x
> z
> w (maybe?)
Solution 2 :
Cela devrait le faire assez efficacement, sur la base des informations sur GPT sur ce site.
Effacez le premier bloc (deux secteurs de 512 octets pour le MBR et l'en-tête, et 16 Kio pour les entrées de partition) :
dd if=/dev/zero of=/dev/sdwhatever bs=512 count=34
La dernière partie est plus délicate. J'emprunte à cette question pour vous aider, bien que si vous avez ddrescue à portée de main, cela peut aller en sens inverse.
dd if=/dev/zero of=/dev/sdwhatever bs=512 count=34 seek=$((`blockdev --getsz /dev/sda` - 34))