J'utilise parfois deux environnements de bureau différents comme Unity et Gnome Shell (comparaison, test, création de captures d'écran, etc.) mais Unity a l'air mauvais en utilisant le thème Adwaita, qui est le même avec le thème Gnome Shell et Ambiance. Changer à chaque fois est assez compliqué et parfois (mais maintenant moins fréquent qu'avant) ça plante (j'utilise Oneiric).
Réponse acceptée :
Vous pouvez essayer de créer un script que vous configurez pour s'exécuter à chaque démarrage où vous reconnaissez quel DE vous utilisez et changez le thème en fonction de ce que vous exécutez