exFAT et NTFS sont des systèmes de fichiers propriétaires de Microsoft. exFAT, également appelé FAT64, est un système de fichiers très simple, pratiquement une extension de FAT32, en raison de sa simplicité, il est bien implémenté sous Linux et très rapide.
Mais en raison de sa structure simple, il est facilement affecté par la fragmentation, de sorte que les performances peuvent facilement diminuer avec l'utilisation.
exFAT ne prend pas en charge la journalisation, ce qui signifie qu'il nécessite une vérification complète en cas d'arrêt incorrect.
NTFS est plus lent que exFAT, en particulier sous Linux, mais il est plus résistant à la fragmentation. En raison de sa nature propriétaire, il n'est pas aussi bien implémenté sous Linux que sous Windows, mais d'après mon expérience, il fonctionne plutôt bien. En cas de corruption, NTFS peut facilement être réparé sous Windows (même pour Linux il y a ntfsfix ) et il existe de nombreux outils capables de récupérer des fichiers perdus.
Personnellement, je préfère NTFS pour sa fiabilité. Une autre option consiste à utiliser ext4 et à monter sous Windows avec extfsd, ext4 est meilleur sous Linux, mais le pilote n'est pas bien implémenté sous Windows. Extfsd ne prend pas entièrement en charge la journalisation, il y a donc un risque à écrire sous Windows, mais ext est plus facile à réparer sous Linux qu'exFAT.
Je vous suggère d'essayer UDF. UDF est un système de fichiers ouvert et indépendant du fournisseur qui a été conçu à l'origine pour être utilisé sur des disques optiques, mais peut également être utilisé R/W sur d'autres lecteurs, y compris les lecteurs USB. UDF prend en charge une taille de système de fichiers maximale de 2 To (avec une taille de bloc de 512 octets), il prend en charge les noms de fichiers Unicode longs et conserve un enregistrement des temps de fichier.
Windows exige apparemment que le disque soit partitionné et le système de fichiers doit être créé avec le type de média hd et une taille de bloc de 512 :
mkudffs --media-type=hd --blocksize=512 /dev/sdxN