Vous pouvez utiliser :
sed -e '/^;/d' php.ini
Vous n'avez pas besoin de diriger un fichier vers grep, grep prend le(s) nom(s) de fichier comme arguments de ligne de commande.
grep -v '^#' file1 file2 file3
imprimera toutes les lignes SAUF celles qui commencent par un caractère #. vous pouvez modifier le caractère de commentaire en ce que vous souhaitez.
Si vous avez plus d'un caractère de commentaire (en supposant qu'il soit au début d'une ligne)
egrep -v '^(;