Avec qpdf :
$ qpdf --decrypt restricted-input.pdf unrestricted-output.pdf
Vous pouvez probablement utiliser pdftk. Quelque chose comme
pdftk in.pdf output out.pdf allow AllFeatures
devrait faire l'affaire.
Si vous avez ghostscript installé essayez simplement :
gs -sPDFPassword=$PASS -q -dNOPAUSE -dBATCH -sDEVICE=pdfwrite -sOutputFile=%stdout% -c .setpdfwrite -f locked.pdf > unlocked.pdf