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Alternative à `memory.size()` de R sous Linux ?

Je pense que cela devrait être géré par le système d'exploitation. Il n'y a pas de limite intégrée à ma connaissance ; si nécessaire, R utilisera toute la mémoire qu'il peut obtenir.

Pour obtenir des informations sur le total et/ou sur la mémoire disponible sous linux, vous pouvez essayer

system('grep MemTotal /proc/meminfo')

ou

system('free -m')

ou

system('lshw -class memory')

La dernière commande vous demandera de l'exécuter en tant que super-utilisateur et vous avertira que la sortie peut ne pas être exacte ; mais d'après mon expérience, il fournira toujours une sortie assez utile.

Pour obtenir des informations sur l'utilisation de la mémoire d'un script R en cours d'exécution, vous pouvez soit surveiller les ressources actuellement utilisées en démarrant top dans un terminal séparé, ou utilisez, par exemple, l'appel système suivant depuis le script R :

system(paste0("cat /proc/",Sys.getpid(),"/status | grep VmSize"))

J'espère que cela vous aidera.


Utiliser pryr bibliothèque :

library("pryr")

mem_used()
# 27.9 MB

x <- mem_used()
x
# 27.9 MB
class(x)
# [1] "bytes"

Le résultat est le même que la réponse de @RHertel, avec pryr nous pouvons affecter le résultat dans une variable.

system('grep MemTotal /proc/meminfo')
# MemTotal:       263844272 kB

Pour affecter à une variable avec appel système, utilisez intern = TRUE :

x <- system('grep MemTotal /proc/meminfo', intern = TRUE)
x
# [1] "MemTotal:       263844272 kB"
class(x)
# [1] "character"

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