Je suis passé d'Ubuntu 10.04 LTS à 12.04 LTS. Ça marche plus ou moins.
Mais les menus globaux ne fonctionnent pas et lorsque j'utilise le HUD, aucun résultat n'apparaît jamais. (Exemple :je recherche "F" (sans les guillemets)) et rien n'est trouvé dans aucune application (Terminal, Dossier d'accueil,…)
J'ai déjà fait :
sudo apt-get install appmenu-gtk appmenu-gtk3 appmenu-qt
Puis redémarré, mais rien.
Des idées ?
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J'ai supprimé ~/.config, ~/.gnome2, ~/.compiz-1, ~/.icons et une douzaine d'autres répertoires de ce type (évidemment déconseillé, mais peu importe…), redémarré, et toujours aucun changement.
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J'ai une NVIDIA GeForce GT 430 et j'utilise les "mises à jour post-version" fournies par le panneau Pilotes supplémentaires dans les paramètres système. C'est peut-être lié ?
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Désinstallé les pilotes mentionnés, redémarré en utilisant le schéma de détection vanille d'Ubuntu, aucun changement.
Réponse acceptée :
Cela m'est également arrivé après la mise à niveau vers 12.04.
Vous devez installer l'indicateur-appmenu 
qui n'a pas été installé sur mon système (ou a été supprimé par le programme d'installation). Après cela, mon menu global fonctionnait parfaitement. (Peut nécessiter une déconnexion et une connexion ou un redémarrage pour se connecter.)
sudo apt-get install indicator-appmenu
Pour postuler immédiatement sans vous reconnecter, redémarrez Unity :ouvrez un terminal et lancez :
unity --replace